SmartChip система основана на применении микрочипа форматом 72 х 72 с общим количеством 5184 нанолунок для проведения соответствующего числа индивидуальных кПЦР реакций. Ген-специфичные праймеры преоптимизированы и заранее нанесены в лиофилизированном виде на микрочип для проведения унифицированной кПЦР. Реакционный объем при нанесении реакционной смеси и пробы - 100 нл.
Нанесение проб на микрочип возможно либо в однопробном режиме при использовании однопробного диспенсера с вакуумной камерой и SmartChip стандартных панелей, либо в выбранном экспериментатором варианте мультипробного нанесения при использовании системы мультипробного нанодиспенсера и SmartChip панели по заказу.
Проведение кПЦР осуществляется в амплификаторе, отличается предельной простотой, и находится под контролем и мониторингом программного обеспечения, предоставленного производителем.
Для проведения нормализации и количественного и статистического анализа данных применяется программное обеспечение от Bio-Gazelle.
Количество проб |
Количество генов |
Количество реплик |
384 |
3 |
4 |
96 |
12 |
4 |
48 |
24 |
4 |
12 |
96 |
4 |
6 |
192 |
4 |
3 |
384 |
4 |
SmartChip кПЦР система реализует новый стандарт для массового количественного анализа экспрессии генов в максимальном на сегодня количестве проб (до 384).
SmartChip кПЦР система предназначена (но не ограничена) следующим диапазоном исследований:
Производительность |
5184 реакции |
Мультипробный формат |
3-384 /384-3 реакций в четырех повторах |
Чувствительность |
3 - 10 копий кДНК |
Специфичность |
< 90 % гомологичности |
Точность, стандартное отклонение Ст |
< 0.10 |
Воспроизводимость, R^2 |
> 0.950 |
Фильтры возбуждения сигнала, nm |
472 / 510 / 543 ± 42 + 3 свободные позиции |
Фильтры детекции сигнала, nm |
550 / 605 / 625 ± 40 + 3 свободные позиции |
Фотодетекция |
CCD, 16 Mp |
Источник света |
250 Вт галогеновая лампа, до 1000 часов |
Температурный контроль |
Пельтье элементы, диапазон 20°С - 95°С |
Нагрев (65°С - 90°С): < 1.5°С/сек |
|
Охлаждение (90°С - 65°С): < 2.0°С/сек |
|
Программное обеспечение |
SmartChip кПЦР - контроль и анализ |